Bioinformatics Q&A
   
  Àú¿Í ÇÔ²² ÀÏÇÒ »ç¶÷À» ã½À´Ï´Ù.
  Writer : Seyeon Weon     Date : 12-23     Hit : 10919    
  Æ®·¢¹é ÁÖ¼Ò : http://www.bioinformatics.pe.kr/gnuboard/bbs/tb.php/qa/114
Á¦°¡ (ÁÖ)¹ÙÀÌ¿À´Ï¾ÆÀÇ »ý¹°Á¤º¸ÇÐ ´ã´ç ÀÌ»ç·Î ÀÏÀ» ÇÏ°Ô µÇ¾î¼­ »õ·Ó°Ô »ý¹°Á¤º¸ÇÐ ¹× Àü»êÆÀÀ» ²Ù¹Ì°í ÀÖ½À´Ï´Ù. ´Ù¾çÇÑ »ç¶÷ÀÌ ÇÊ¿äÇѵ¥, ¾Æ·¡¿Í °°½À´Ï´Ù.
  1. Àü»êÆÀÀ» ÆÀÀåÀ¸·Î¼­ À̲ø »ç¶÷
  2. À¥ ÇÁ·Î±×·¡¸Ó
  3. bioinformatics °ü·Ã ÇÁ·Î±×·¡¸Ó
  4. DNA microarray µðÀÚÀÎ ¹× µ¥ÀÌÅÍ ºÐ¼®
  5. SNP µðÀÚÀÎ ¹× µ¥ÀÌÅÍ ºÐ¼®
ÇöÀç (ÁÖ)¹ÙÀÌ¿À´Ï¾Æ´Â ÀÚü °³¹ßÇÑ synthetic oligonucleotide ´ë·® »ý»ê ±â¼úÀ» °¡Áö°í ÀÖÀ¸¸ç, ǰÁúÀ̳ª »ý»ê·® ¸é¿¡¼­ ¼¼°èÀûÀ¸·Î ÀÎÁ¤À» ¹Þ°í ÀÖ½À´Ï´Ù. ±¹³» ½ÃÀåÀÇ Á¡À¯À²Àº 50%°¡ ³ÑÀ¸¸ç, ÀÌ ±â¼úÀ» ¹ÙÅÁÀ¸·Î ÃÖ±Ù¿¡ ¹Ì±¹¿¡µµ ȸ»ç¸¦ ¸¸µé¾ú´Âµ¥, ͏®Æ÷´Ï¾Æ Alameda¿¡ À§Ä¡Çϰí À־ ÇöÀç ½Ç¸®ÄÜ ¹ë¸®¿¡ À§Ä¡ÇÑ biotech ±â¾÷µé°ú Stanford¸¦ ºñ·ÔÇÑ ±Ùó ´ëÇеé·ÎºÎÅÍ ´ë·® ÁÖ¹®µéÀÌ µé¾î¿À°í ÀÖ½À´Ï´Ù. ¿¹¸¦ µé¾î, genome Àüü¸¦ coverÇÏ´Â ¼ö¸¸ °³ÀÇ synthetic oligonucleotide set°ú °°Àº °ÍµéÀÔ´Ï´Ù. ¹Ì±¹ ȸ»ç Ȩ ÆäÀÌÁö´Â À̰÷ÀÔ´Ï´Ù.
 
(ÁÖ)¹ÙÀÌ¿À´Ï¾Æ´Â synthetic oligonucleotide À̿ܿ¡ ºÐÀÚ»ý¹°ÇÐ ½ÇÇè¿¡ ÇÊ¿äÇÑ ½Ã¾à°ú ÀåºñµéÀ» ´Ù¾çÇÏ°Ô ¸¸µé¾î¼­ ÆÄ´Â ȸ»çÀÔ´Ï´Ù. µû¶ó¼­ À̸¦ À§ÇÑ À¥ ¼­ºñ½ºµµ Áß¿äÇѵ¥, À§¿¡¼­ 1¹ø°ú 2¹øÀº À̸¦ ÇØ³¾ »ç¶÷µéÀÔ´Ï´Ù. ±×¸®°í genome informationÀ» ƯÈ÷ synthetic oligonucleotide¿Í ¿¬°áÇÏ¿© À¥ ¼­ºñ½º·Î ¸¸µå´Â Àϵµ Áß¿äÇѵ¥, À̸¦ À§Çؼ­´Â bioinformatics Áö½Ä°ú À¥ ÇÁ·Î±×·¡¹Ö ±â¼úÀÌ ÇÔ²² ÇÊ¿äÇÏ°Ô µË´Ï´Ù.
 
(ÁÖ)¹ÙÀÌ¿À´Ï¾Æ´Â ÃÖÃÊ·Î ±¹³» ±â¼ú·Î ¹Ì±¹À» ºñ·ÔÇÑ ¼¼°è·Î ÁøÃâÇϰí ÀÖ´Â biotech ±â¾÷ÀÏ °ÍÀÔ´Ï´Ù. (¹°·Ð °Ç°­º¸Á¶½Äǰ°ú °°Àº °Íµéµµ ±¹³»¿¡¼­´Â biotech ±â¾÷À¸·Î ºÐ·ù¸¦ ÇÏÁö¸¸, ¼±Áø±¹µé¿¡¼­ »ç¿ëÇÏ´Â ºÐ·ù¿¡ µû¸£¸é ±×·¯ÇÒ °ÍÀÔ´Ï´Ù.) ÁÖ·Â Á¦Ç°ÀÎ synthetic oligonucleotideÀÇ »ý»ê ±â¼úÀº ÀÌ¹Ì °®Ãß¾îÁ® ÀÖÀ¸´Ï, ÀÌÁ¦ À̸¦ µÞ¹ÞħÇÒ informatics¸¸ °®Ãß¸é ±×¾ß¸»·Î ¿ì¸® ÈûÀ¸·Î ¼¼°è½ÃÀåÀ» ´©ºô ¼ö ÀÖ°Ô µË´Ï´Ù. ÇöÀç À̹̠°®Ãß¾îÁø »ý»ê °¡´ÉÇÑ ¾çÀÇ °íÀÛ 5%¸¸À» ½ÇÁ¦·Î »ý»êÇϰí Àִµ¥, ±× °¡Àå °áÁ¤ÀûÀΠÀÌÀ¯°¡ informaticsÀÇ ¹ÌºñÀÔ´Ï´Ù. µû¶ó¼­ ÀúÈñ ÆÀ¿¡ ÇÕ·ù¸¦ ÇϽøé, ´çÀå °æÁ¦ÀûÀÎ °¡Ä¡°¡ »ý»êµÇ´Â ÀÏÀ», ´õ¿íÀÌ Àü¼¼°è »ý¹°ºÐ¾ßÀÇ ÁÖ¿äÇÑ ¿¬±¸ÀÚµéÀ» ´ë»óÀ¸·Î ÇÏ´Â ÀÏÀ» ÇÏ°Ô µË´Ï´Ù.
 
À§¿¡¼­ DNA microarray¿¡ ´ëÇÑ °ÍÀº, ÇöÀç ÃßÁøµÇ°í ÀÖ´Â °ÍÀº Schizosaccharomyces pombeÀÇ Àüü genomeÀÇ knockout mutant library¿¡ ´ëÇÑ arrayÀε¥, ÀåÂ÷ ºÐ¾ß¸¦ ³ÐÇô°¥ °ÍÀÔ´Ï´Ù. ÀÌ chipÀº Affymetrix»ç¿¡¼­ OEM ¹æ½ÄÀ¸·Î »ý»êÀ» ÇÏ¿© µ¶Á¡ °ø±ÞÀ» ÇÏ°Ô µË´Ï´Ù. (½ÃÁ¦Ç° °ËÁõÀº ¸¶ÃÆÀ¸¸ç, ÇöÀç º»°ÝÀûÀÎ »ý»êÀ» À§ÇÑ OEM °è¾à ÁøÇà Áß) ÀÌ Schizosaccharomyces pombe library¿¡ ´ëÇÑ Á¤º¸´Â À̰÷¿¡ ÀÖ½À´Ï´Ù.
 
±×¸®°í SNP¿¡ ´ëÇÑ °ÍÀº, ¿ì¼± ¹Ì±¹ Sequenom»çÀÇ SNP typing Àåºñ¿¡ »ç¿ëµÉ synthetic oligonucleotideµéÀÌ ½É¾îÁø ÆÐ³ÎÀ» µðÀÚÀÎÇÏ´Â ÀÏÀÔ´Ï´Ù. ¶ÇÇÑ ±¹³»¿¡´Â SNP µ¥ÀÌÅ͸¦ ´Ù·ç°í ºÐ¼®ÇÒ ÀηÂÀÌ ºÎÁ·ÇϹǷÎ, ÀÌ¹Ì ±¹³»¿¡ °ø±ÞÀÌ ½ÃÀÛµÈ Sequenom»çÀÇ Àåºñ·ÎºÎÅÍ »ý»êµÇ´Â µ¥ÀÌÅÍ¿¡ ´ëÇÑ ºÐ¼®¿¡µµ Âü¿©¸¦ ÇØ¾ß ÇÕ´Ï´Ù.
 
±Ù¹« Àå¼Ò´Â ´ëÀüÀÇ ´ë´ö¿¬±¸´ÜÁö ±ÙóÀÔ´Ï´Ù. ¿¬ºÀÀº ¹°·Ð »ç¶÷¿¡ µû¶ó ´Ù¸£°Ô Ã¥Á¤ÀÌ µÇ¾î¾ß°ÚÁö¸¸, ÇÑ ¸¶µð ÀûÀ¸¸é, À§¿¡ ¼³¸íÇÑ Àϰú °°Àº Áß¿äÇÑ ÀÏÀ» Á¦´ë·Î Çس»°íÀÚ Çϸ鼭 ½Ñ ÀÓ±ÝÀ¸·Î ¾î¶»°Ô ÇØº¸°íÀÚ ÇÏ´Â »ý°¢À» Çϰí ÀÖÀ» ¸®´Â ¾øÀ» °ÍÀÔ´Ï´Ù. ¹®ÀǴ À̰÷¿¡ ÀÖ´Â email ÁÖ¼Ò·Î ÇÏ½Ã¸é µË´Ï´Ù.